食品殺菌就是以食品原料、產品加工為對象，通過對引起食品變質的主要因素---微生物的殺菌及滅菌，達到食品品質的穩定化，有效延長食品的保質期，并因此降低食品中有害細菌對人體的感染及傷害。

 食品殺菌設備是任何食品加工企業必備的設備之一。目前食品殺菌設備分類為微波殺菌設備、巴氏殺菌、高溫高壓殺菌鍋（水浴式）、紫外線殺菌、臭氧殺菌等等。

 微波食品殺菌設備是通過微波熱效應和非熱效應共同作用的結果。微波殺菌設備的熱效應主要起快速升溫殺菌作用：而非熱效應則使用微生物體內蛋白質和生理活性物質發生變異，而喪失活力或死亡。因此，微波食品殺菌機的殺菌溫度較低于常規方法，常規方法殺菌溫度要在120度以上，時間要在十幾分鐘至幾十分鐘，而微波殺菌溫度僅在70至90度，時間約為幾分鐘。

 通過微波殺菌處理后的食品的保質期可延長3~8倍，不破壞原有的營養成份、色澤、口感和天然風味。與其它干燥、殺菌、解凍設備相比，可縮小占地面積、降低能耗30%~100%。而且不生產“三廢”污染。

 微波食品殺菌機還可應用于對其它食品的殺菌處理，例如：瓶裝食品、真空包裝食品、熟食殺菌機、鹵肉、粉狀食品、營養粉、芝麻糊、藕粉、調味食品、豆腐乳、辣椒醬、甜面醬、罐頭食品、罐頭飲料等等。